Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX9P55771 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX9P55771 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX9P55771 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX9P55771 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX9P55771 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX9P55771 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX9P55771 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX9P55771 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX9P55771 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX9P55771 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX9P55771 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX9P55771 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX9P55771 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX9P55771 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX9P55771 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX9P55771 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX9P55771 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX9P55771 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX9P55771 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX9P55771 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX9P55771 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX9P55771 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX9P55771 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX9P55771 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX9P55771 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX9P55771 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX9P55771 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX9P55771 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX9P55771 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX9P55771 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX9P55771 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX9P55771 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX9P55771 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX9P55771 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX9P55771 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX9P55771 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX9P55771 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX9P55771 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX9P55771 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX9P55771 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX9P55771 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX9P55771 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX9P55771 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX9P55771 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX9P55771 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX9P55771 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX9P55771 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX9P55771 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX9P55771 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX9P55771 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX9P55771 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX9P55771 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX9P55771 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX9P55771 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX9P55771 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX9P55771 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX9P55771 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX9P55771 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX9P55771 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX9P55771 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX9P55771 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX9P55771 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX9P55771 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX9P55771 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX9P55771 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX9P55771 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX9P55771 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX9P55771 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX9P55771 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX9P55771 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX9P55771 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX9P55771 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX9P55771 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX9P55771 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX9P55771 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX9P55771 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX9P55771 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX9P55771 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX9P55771 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX9P55771 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX9P55771 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX9P55771 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX9P55771 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX9P55771 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX9P55771 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX9P55771 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX9P55771 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX9P55771 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX9P55771 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX9P55771 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX9P55771 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX9P55771 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX9P55771 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX9P55771 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX9P55771 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX9P55771 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX9P55771 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX9P55771 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX9P55771 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms