Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
AFDNP55196 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
AFDNP55196 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
AFDNP55196 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
AFDNP55196 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
AFDNP55196 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
AFDNP55196 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
AFDNP55196 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
AFDNP55196 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
AFDNP55196 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
AFDNP55196 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
AFDNP55196 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
AFDNP55196 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
AFDNP55196 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
AFDNP55196 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
AFDNP55196 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
AFDNP55196 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
AFDNP55196 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
AFDNP55196 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
AFDNP55196 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
AFDNP55196 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
AFDNP55196 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
AFDNP55196 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
AFDNP55196 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
AFDNP55196 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
AFDNP55196 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
AFDNP55196 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
AFDNP55196 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
AFDNP55196 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
AFDNP55196 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
AFDNP55196 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
AFDNP55196 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
AFDNP55196 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
AFDNP55196 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
AFDNP55196 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
AFDNP55196 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
AFDNP55196 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
AFDNP55196 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
AFDNP55196 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
AFDNP55196 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
AFDNP55196 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.37
AFDNP55196 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
AFDNP55196 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
AFDNP55196 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
AFDNP55196 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
AFDNP55196 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
AFDNP55196 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
AFDNP55196 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
AFDNP55196 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
AFDNP55196 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
AFDNP55196 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
AFDNP55196 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
AFDNP55196 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
AFDNP55196 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
AFDNP55196 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
AFDNP55196 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
AFDNP55196 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
AFDNP55196 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
AFDNP55196 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
AFDNP55196 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
AFDNP55196 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
AFDNP55196 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
AFDNP55196 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
AFDNP55196 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
AFDNP55196 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
AFDNP55196 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
AFDNP55196 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
AFDNP55196 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
AFDNP55196 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
AFDNP55196 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
AFDNP55196 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
AFDNP55196 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
AFDNP55196 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
AFDNP55196 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
AFDNP55196 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
AFDNP55196 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
AFDNP55196 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
AFDNP55196 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
AFDNP55196 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
AFDNP55196 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
AFDNP55196 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
AFDNP55196 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
AFDNP55196 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
AFDNP55196 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
AFDNP55196 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
AFDNP55196 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
AFDNP55196 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
AFDNP55196 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
AFDNP55196 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
AFDNP55196 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
AFDNP55196 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
AFDNP55196 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
AFDNP55196 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
AFDNP55196 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
AFDNP55196 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
AFDNP55196 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
AFDNP55196 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
AFDNP55196 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
AFDNP55196 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
AFDNP55196 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms