Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EMP1P54849 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EMP1P54849 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EMP1P54849 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EMP1P54849 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EMP1P54849 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EMP1P54849 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EMP1P54849 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EMP1P54849 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMP1P54849 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMP1P54849 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMP1P54849 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMP1P54849 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMP1P54849 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMP1P54849 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMP1P54849 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMP1P54849 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMP1P54849 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EMP1P54849 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMP1P54849 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMP1P54849 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMP1P54849 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMP1P54849 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMP1P54849 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP1P54849 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP1P54849 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP1P54849 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP1P54849 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP1P54849 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP1P54849 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP1P54849 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP1P54849 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP1P54849 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP1P54849 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP1P54849 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP1P54849 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP1P54849 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP1P54849 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP1P54849 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP1P54849 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP1P54849 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP1P54849 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP1P54849 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP1P54849 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP1P54849 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP1P54849 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP1P54849 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP1P54849 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP1P54849 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP1P54849 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP1P54849 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP1P54849 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP1P54849 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP1P54849 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP1P54849 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP1P54849 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP1P54849 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP1P54849 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP1P54849 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP1P54849 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP1P54849 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP1P54849 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP1P54849 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP1P54849 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP1P54849 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP1P54849 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP1P54849 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP1P54849 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP1P54849 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP1P54849 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP1P54849 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMP1P54849 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMP1P54849 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMP1P54849 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMP1P54849 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMP1P54849 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMP1P54849 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMP1P54849 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMP1P54849 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMP1P54849 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMP1P54849 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMP1P54849 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EMP1P54849 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMP1P54849 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMP1P54849 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMP1P54849 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMP1P54849 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMP1P54849 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMP1P54849 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMP1P54849 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMP1P54849 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMP1P54849 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMP1P54849 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMP1P54849 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMP1P54849 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMP1P54849 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMP1P54849 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMP1P54849 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMP1P54849 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMP1P54849 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms