Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMS2P54278 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMS2P54278 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMS2P54278 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PMS2P54278 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMS2P54278 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMS2P54278 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMS2P54278 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PMS2P54278 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PMS2P54278 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PMS2P54278 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PMS2P54278 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PMS2P54278 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PMS2P54278 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PMS2P54278 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PMS2P54278 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMS2P54278 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMS2P54278 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMS2P54278 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMS2P54278 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMS2P54278 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMS2P54278 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMS2P54278 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMS2P54278 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMS2P54278 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PMS2P54278 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMS2P54278 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PMS2P54278 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PMS2P54278 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PMS2P54278 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMS2P54278 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMS2P54278 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMS2P54278 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMS2P54278 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMS2P54278 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMS2P54278 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMS2P54278 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMS2P54278 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMS2P54278 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMS2P54278 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PMS2P54278 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PMS2P54278 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PMS2P54278 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PMS2P54278 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PMS2P54278 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PMS2P54278 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PMS2P54278 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PMS2P54278 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PMS2P54278 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PMS2P54278 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMS2P54278 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMS2P54278 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMS2P54278 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMS2P54278 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMS2P54278 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMS2P54278 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMS2P54278 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMS2P54278 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMS2P54278 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PMS2P54278 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PMS2P54278 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PMS2P54278 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PMS2P54278 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PMS2P54278 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PMS2P54278 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PMS2P54278 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PMS2P54278 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PMS2P54278 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PMS2P54278 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PMS2P54278 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PMS2P54278 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PMS2P54278 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PMS2P54278 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PMS2P54278 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PMS2P54278 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PMS2P54278 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PMS2P54278 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PMS2P54278 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PMS2P54278 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PMS2P54278 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PMS2P54278 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PMS2P54278 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PMS2P54278 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PMS2P54278 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PMS2P54278 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PMS2P54278 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PMS2P54278 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PMS2P54278 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PMS2P54278 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PMS2P54278 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PMS2P54278 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PMS2P54278 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PMS2P54278 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PMS2P54278 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PMS2P54278 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PMS2P54278 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PMS2P54278 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PMS2P54278 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PMS2P54278 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PMS2P54278 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms