Protein–RNA interactions for Protein: P52306

RAP1GDS1, Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GDS1P52306 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAP1GDS1P52306 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms