Protein–RNA interactions for Protein: P51970

NDUFA8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA8P51970 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NDUFA8P51970 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NDUFA8P51970 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NDUFA8P51970 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NDUFA8P51970 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NDUFA8P51970 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NDUFA8P51970 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NDUFA8P51970 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NDUFA8P51970 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NDUFA8P51970 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NDUFA8P51970 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NDUFA8P51970 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NDUFA8P51970 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NDUFA8P51970 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NDUFA8P51970 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NDUFA8P51970 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NDUFA8P51970 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NDUFA8P51970 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NDUFA8P51970 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NDUFA8P51970 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NDUFA8P51970 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NDUFA8P51970 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NDUFA8P51970 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NDUFA8P51970 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NDUFA8P51970 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NDUFA8P51970 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NDUFA8P51970 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NDUFA8P51970 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NDUFA8P51970 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NDUFA8P51970 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NDUFA8P51970 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NDUFA8P51970 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NDUFA8P51970 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NDUFA8P51970 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NDUFA8P51970 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NDUFA8P51970 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NDUFA8P51970 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NDUFA8P51970 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NDUFA8P51970 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NDUFA8P51970 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NDUFA8P51970 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NDUFA8P51970 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NDUFA8P51970 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NDUFA8P51970 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NDUFA8P51970 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NDUFA8P51970 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NDUFA8P51970 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NDUFA8P51970 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NDUFA8P51970 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NDUFA8P51970 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NDUFA8P51970 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NDUFA8P51970 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118 ms