Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC42.68■■■■■ 4.42
SMARCA4P51532 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
SMARCA4P51532 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
SMARCA4P51532 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
SMARCA4P51532 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
SMARCA4P51532 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
SMARCA4P51532 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC42.66■■■■■ 4.42
SMARCA4P51532 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
SMARCA4P51532 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
SMARCA4P51532 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
SMARCA4P51532 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
SMARCA4P51532 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
SMARCA4P51532 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
SMARCA4P51532 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC42.64■■■■■ 4.42
SMARCA4P51532 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
SMARCA4P51532 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.41
SMARCA4P51532 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.41
SMARCA4P51532 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
SMARCA4P51532 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
SMARCA4P51532 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
SMARCA4P51532 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
SMARCA4P51532 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
SMARCA4P51532 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
SMARCA4P51532 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
SMARCA4P51532 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
SMARCA4P51532 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
SMARCA4P51532 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
SMARCA4P51532 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC42.6■■■■■ 4.41
SMARCA4P51532 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC42.59■■■■■ 4.41
SMARCA4P51532 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
SMARCA4P51532 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
SMARCA4P51532 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.58■■■■■ 4.41
SMARCA4P51532 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
SMARCA4P51532 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
SMARCA4P51532 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
SMARCA4P51532 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.4
SMARCA4P51532 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
SMARCA4P51532 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
SMARCA4P51532 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
SMARCA4P51532 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC42.56■■■■■ 4.4
SMARCA4P51532 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC42.56■■■■■ 4.4
SMARCA4P51532 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
SMARCA4P51532 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
SMARCA4P51532 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC42.55■■■■■ 4.4
SMARCA4P51532 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC42.55■■■■■ 4.4
SMARCA4P51532 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
SMARCA4P51532 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC42.54■■■■■ 4.4
SMARCA4P51532 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
SMARCA4P51532 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
SMARCA4P51532 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
SMARCA4P51532 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
SMARCA4P51532 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
SMARCA4P51532 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
SMARCA4P51532 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
SMARCA4P51532 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC42.52■■■■■ 4.4
SMARCA4P51532 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
SMARCA4P51532 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
SMARCA4P51532 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC42.52■■■■■ 4.4
SMARCA4P51532 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
SMARCA4P51532 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
SMARCA4P51532 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
SMARCA4P51532 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
SMARCA4P51532 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.5■■■■■ 4.39
SMARCA4P51532 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
SMARCA4P51532 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC42.49■■■■■ 4.39
SMARCA4P51532 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
SMARCA4P51532 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
SMARCA4P51532 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
SMARCA4P51532 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
SMARCA4P51532 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
SMARCA4P51532 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
SMARCA4P51532 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
SMARCA4P51532 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
SMARCA4P51532 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
SMARCA4P51532 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
SMARCA4P51532 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC42.47■■■■■ 4.39
SMARCA4P51532 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
SMARCA4P51532 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
SMARCA4P51532 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
SMARCA4P51532 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
SMARCA4P51532 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
SMARCA4P51532 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
SMARCA4P51532 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
SMARCA4P51532 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
SMARCA4P51532 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
SMARCA4P51532 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
SMARCA4P51532 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
SMARCA4P51532 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
SMARCA4P51532 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
SMARCA4P51532 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
SMARCA4P51532 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
SMARCA4P51532 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
SMARCA4P51532 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
SMARCA4P51532 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
SMARCA4P51532 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
SMARCA4P51532 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC42.42■■■■■ 4.38
SMARCA4P51532 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
SMARCA4P51532 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
SMARCA4P51532 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
SMARCA4P51532 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms