Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX5P50542 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX5P50542 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX5P50542 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX5P50542 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX5P50542 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX5P50542 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX5P50542 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX5P50542 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX5P50542 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX5P50542 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX5P50542 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX5P50542 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX5P50542 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX5P50542 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX5P50542 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX5P50542 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX5P50542 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX5P50542 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX5P50542 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX5P50542 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX5P50542 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX5P50542 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX5P50542 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX5P50542 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX5P50542 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX5P50542 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX5P50542 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX5P50542 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX5P50542 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX5P50542 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX5P50542 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX5P50542 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX5P50542 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX5P50542 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX5P50542 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX5P50542 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX5P50542 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX5P50542 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX5P50542 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX5P50542 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX5P50542 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX5P50542 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX5P50542 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PEX5P50542 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PEX5P50542 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PEX5P50542 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PEX5P50542 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PEX5P50542 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PEX5P50542 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PEX5P50542 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PEX5P50542 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX5P50542 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX5P50542 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX5P50542 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX5P50542 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX5P50542 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX5P50542 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX5P50542 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX5P50542 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PEX5P50542 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PEX5P50542 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PEX5P50542 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PEX5P50542 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PEX5P50542 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PEX5P50542 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PEX5P50542 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX5P50542 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX5P50542 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX5P50542 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX5P50542 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX5P50542 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX5P50542 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX5P50542 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX5P50542 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX5P50542 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX5P50542 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX5P50542 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX5P50542 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX5P50542 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX5P50542 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX5P50542 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX5P50542 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX5P50542 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX5P50542 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX5P50542 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX5P50542 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX5P50542 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PEX5P50542 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PEX5P50542 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PEX5P50542 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PEX5P50542 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PEX5P50542 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PEX5P50542 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PEX5P50542 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PEX5P50542 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PEX5P50542 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PEX5P50542 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PEX5P50542 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX5P50542 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms