Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCT5P48643 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCT5P48643 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCT5P48643 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCT5P48643 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCT5P48643 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCT5P48643 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCT5P48643 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCT5P48643 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCT5P48643 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT5P48643 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT5P48643 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT5P48643 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT5P48643 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT5P48643 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT5P48643 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT5P48643 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT5P48643 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT5P48643 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT5P48643 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCT5P48643 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCT5P48643 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCT5P48643 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT5P48643 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT5P48643 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT5P48643 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT5P48643 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT5P48643 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT5P48643 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT5P48643 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT5P48643 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT5P48643 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT5P48643 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT5P48643 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT5P48643 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT5P48643 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCT5P48643 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCT5P48643 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCT5P48643 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCT5P48643 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCT5P48643 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCT5P48643 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCT5P48643 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCT5P48643 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT5P48643 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT5P48643 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT5P48643 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT5P48643 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT5P48643 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT5P48643 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT5P48643 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT5P48643 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCT5P48643 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCT5P48643 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCT5P48643 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCT5P48643 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCT5P48643 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCT5P48643 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCT5P48643 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCT5P48643 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCT5P48643 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCT5P48643 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCT5P48643 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCT5P48643 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCT5P48643 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCT5P48643 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCT5P48643 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCT5P48643 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCT5P48643 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCT5P48643 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCT5P48643 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCT5P48643 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCT5P48643 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCT5P48643 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCT5P48643 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCT5P48643 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCT5P48643 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCT5P48643 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCT5P48643 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCT5P48643 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCT5P48643 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCT5P48643 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCT5P48643 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCT5P48643 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCT5P48643 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCT5P48643 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCT5P48643 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCT5P48643 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCT5P48643 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCT5P48643 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCT5P48643 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCT5P48643 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCT5P48643 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCT5P48643 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCT5P48643 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCT5P48643 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCT5P48643 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCT5P48643 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCT5P48643 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCT5P48643 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms