Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIA4P48058 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms