Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RECQLP46063 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RECQLP46063 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RECQLP46063 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RECQLP46063 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RECQLP46063 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RECQLP46063 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RECQLP46063 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RECQLP46063 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RECQLP46063 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RECQLP46063 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RECQLP46063 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RECQLP46063 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RECQLP46063 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RECQLP46063 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RECQLP46063 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RECQLP46063 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RECQLP46063 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RECQLP46063 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RECQLP46063 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RECQLP46063 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RECQLP46063 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RECQLP46063 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RECQLP46063 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RECQLP46063 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RECQLP46063 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RECQLP46063 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RECQLP46063 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RECQLP46063 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RECQLP46063 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RECQLP46063 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RECQLP46063 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RECQLP46063 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RECQLP46063 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RECQLP46063 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RECQLP46063 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RECQLP46063 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RECQLP46063 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RECQLP46063 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RECQLP46063 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RECQLP46063 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RECQLP46063 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RECQLP46063 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RECQLP46063 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RECQLP46063 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RECQLP46063 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RECQLP46063 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RECQLP46063 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RECQLP46063 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RECQLP46063 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RECQLP46063 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RECQLP46063 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RECQLP46063 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RECQLP46063 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RECQLP46063 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RECQLP46063 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RECQLP46063 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RECQLP46063 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RECQLP46063 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RECQLP46063 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RECQLP46063 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RECQLP46063 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RECQLP46063 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RECQLP46063 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RECQLP46063 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RECQLP46063 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RECQLP46063 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RECQLP46063 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RECQLP46063 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RECQLP46063 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RECQLP46063 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RECQLP46063 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RECQLP46063 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RECQLP46063 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RECQLP46063 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RECQLP46063 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RECQLP46063 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RECQLP46063 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RECQLP46063 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RECQLP46063 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RECQLP46063 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RECQLP46063 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RECQLP46063 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RECQLP46063 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RECQLP46063 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RECQLP46063 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RECQLP46063 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RECQLP46063 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RECQLP46063 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RECQLP46063 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RECQLP46063 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RECQLP46063 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RECQLP46063 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RECQLP46063 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RECQLP46063 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RECQLP46063 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RECQLP46063 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RECQLP46063 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RECQLP46063 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RECQLP46063 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms