Protein–RNA interactions for Protein: P43243

MATR3, Matrin-3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATR3P43243 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.293e-8■■■■■ 27.9
MATR3P43243 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.283e-8■■■■■ 27.9
MATR3P43243 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.233e-8■■■■■ 27.9
MATR3P43243 ZNF618-202ENST00000374124 1156 ntTSL 515.77■□□□□ 0.123e-8■■■■■ 27.9
MATR3P43243 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.022e-11■■■■■ 27.9
MATR3P43243 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.032e-11■■■■■ 27.9
MATR3P43243 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.082e-11■■■■■ 27.9
MATR3P43243 ZNF618-204ENST00000452710 942 ntTSL 513.56□□□□□ -0.243e-8■■■■■ 27.9
MATR3P43243 GANAB-216ENST00000540933 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.393e-8■■■■■ 27.9
MATR3P43243 UVRAG-207ENST00000531818 3152 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.423e-8■■■■■ 27.9
MATR3P43243 AC010601.1-201ENST00000569048 446 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.453e-8■■■■■ 27.9
MATR3P43243 UVRAG-209ENST00000533454 1823 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.473e-8■■■■■ 27.9
MATR3P43243 GANAB-201ENST00000346178 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.623e-8■■■■■ 27.9
MATR3P43243 GANAB-211ENST00000532402 3718 ntTSL 1 (best)10.96□□□□□ -0.653e-8■■■■■ 27.9
MATR3P43243 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.683e-8■■■■■ 27.9
MATR3P43243 LINC01090-201ENST00000415357 881 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.733e-8■■■■■ 27.9
MATR3P43243 GANAB-202ENST00000356638 3608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.733e-8■■■■■ 27.9
MATR3P43243 PROSER1-205ENST00000484434 2150 ntTSL 210.22□□□□□ -0.772e-15■■■■■ 27.9
MATR3P43243 UVRAG-208ENST00000532130 1831 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.83e-8■■■■■ 27.9
MATR3P43243 UVRAG-202ENST00000525183 1325 ntTSL 29.9□□□□□ -0.823e-8■■■■■ 27.9
MATR3P43243 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.253e-8■■■■■ 27.9
MATR3P43243 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.383e-8■■■■■ 27.9
MATR3P43243 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.923e-8■■■■■ 27.9
MATR3P43243 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.477e-7■■■■■ 27.9
MATR3P43243 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.342e-9■■■■■ 27.9
MATR3P43243 AL354993.2-201ENST00000558738 542 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 27.9
MATR3P43243 AL109930.1-201ENST00000606932 724 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.872e-7■■■■■ 27.9
MATR3P43243 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.982e-7■■■■■ 27.9
MATR3P43243 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.962e-7■■■■■ 27.9
MATR3P43243 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.832e-7■■■■■ 27.9
MATR3P43243 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.472e-7■■■■■ 27.9
MATR3P43243 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.472e-7■■■■■ 27.9
MATR3P43243 TMEM263-202ENST00000547081 833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 27.9
MATR3P43243 ZNF326-204ENST00000394583 1956 ntTSL 1 (best)20.29■□□□□ 0.843e-7■■■■■ 27.9
MATR3P43243 ZNF326-201ENST00000340281 2729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.33e-7■■■■■ 27.9
MATR3P43243 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.083e-7■■■■■ 27.9
MATR3P43243 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.82e-6■■■■■ 27.9
MATR3P43243 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.792e-6■■■■■ 27.9
MATR3P43243 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.652e-6■■■■■ 27.9
MATR3P43243 MAGI2-236ENST00000637441 5822 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 27.9
MATR3P43243 MAU2-216ENST00000609122 551 ntTSL 422.06■■□□□ 1.126e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.326e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 MAU2-205ENST00000586189 590 ntTSL 516.96■□□□□ 0.316e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.62e-6■■■■■ 27.8
MATR3P43243 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 27.8
MATR3P43243 SPIDR-214ENST00000521550 1849 ntTSL 215.2■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 27.8
MATR3P43243 SPIDR-217ENST00000522117 2745 ntTSL 213.3□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 27.8
MATR3P43243 SPIDR-212ENST00000519661 1035 ntTSL 212.48□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 27.8
MATR3P43243 SPIDR-206ENST00000518074 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 27.8
MATR3P43243 SPIDR-222ENST00000524006 970 ntTSL 511.7□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 27.8
MATR3P43243 SPIDR-224ENST00000524126 2614 ntTSL 1 (best)11.41□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 27.8
MATR3P43243 SPIDR-225ENST00000524141 2761 ntTSL 211.39□□□□□ -0.592e-6■■■■■ 27.8
MATR3P43243 SPIDR-213ENST00000521214 3577 ntTSL 28.69□□□□□ -1.022e-6■■■■■ 27.8
MATR3P43243 SPIDR-223ENST00000524033 1023 ntTSL 28.46□□□□□ -1.062e-6■■■■■ 27.8
MATR3P43243 KDM4B-205ENST00000588337 504 ntTSL 529.37■■■□□ 2.291e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 SPATS2-212ENST00000549298 643 ntTSL 326.19■■□□□ 1.781e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 SPATS2-218ENST00000551540 720 ntTSL 525■■□□□ 1.591e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 SPATS2-211ENST00000549179 570 ntTSL 425■■□□□ 1.591e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.481e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 SPATS2-209ENST00000548777 505 ntTSL 324.06■■□□□ 1.441e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 NSFL1C-209ENST00000489203 694 ntTSL 323.91■■□□□ 1.421e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 NSFL1C-203ENST00000381653 1446 ntTSL 523.8■■□□□ 1.41e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 NSFL1C-205ENST00000470376 845 ntTSL 323.71■■□□□ 1.391e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 SPATS2-214ENST00000549412 2781 ntTSL 223.06■■□□□ 1.281e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 NSFL1C-211ENST00000555359 450 ntTSL 322.97■■□□□ 1.271e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.241e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 UBE2Q2P1-201ENST00000339094 2150 ntTSL 222.76■■□□□ 1.231e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.231e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 ENTPD6-215ENST00000471478 991 ntTSL 521.83■■□□□ 1.091e-14■■■■■ 27.8
MATR3P43243 RSF1-202ENST00000440064 604 ntTSL 521.76■■□□□ 1.071e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.961e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 ENTPD6-213ENST00000447877 932 ntTSL 520.77■□□□□ 0.921e-14■■■■■ 27.8
MATR3P43243 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.81e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.791e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.761e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 NSFL1C-213ENST00000555944 2588 ntTSL 219.8■□□□□ 0.761e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.751e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 NSFL1C-212ENST00000555568 863 ntTSL 319.69■□□□□ 0.741e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.731e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.711e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 HDAC4-211ENST00000494800 451 ntTSL 519.34■□□□□ 0.691e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 RSF1-206ENST00000528095 2107 ntTSL 1 (best)19.24■□□□□ 0.671e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.651e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.651e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.61e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 SPATS2-205ENST00000548388 564 ntTSL 218.79■□□□□ 0.61e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 SPATS2-219ENST00000552171 465 ntTSL 518.79■□□□□ 0.61e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.581e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 MYO1B-205ENST00000418908 572 ntTSL 418.61■□□□□ 0.571e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 APIP-202ENST00000527830 1042 ntTSL 218.59■□□□□ 0.571e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 NSFL1C-208ENST00000487086 456 ntTSL 218.2■□□□□ 0.51e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 ENTPD6-204ENST00000376666 2100 ntTSL 516.91■□□□□ 0.31e-14■■■■■ 27.8
MATR3P43243 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.291e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 ALDH1L1-211ENST00000473607 2192 ntTSL 1 (best)16.71■□□□□ 0.271e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 RSF1-203ENST00000467567 2982 ntTSL 216.44■□□□□ 0.221e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.221e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 SPATS2-217ENST00000550997 675 ntTSL 516.27■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 SPATS2-216ENST00000550643 527 ntTSL 416.22■□□□□ 0.191e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.151e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 ALDH1L1-212ENST00000476245 4604 ntTSL 1 (best)15.95■□□□□ 0.141e-7■■■■■ 27.8
Retrieved 100 of 16,209 protein–RNA pairs in 64.7 ms