Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEACAM3P40198 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CEACAM3P40198 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms