Protein–RNA interactions for Protein: P38398

BRCA1, Breast cancer type 1 susceptibility protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA1P38398 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRCA1P38398 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRCA1P38398 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRCA1P38398 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRCA1P38398 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRCA1P38398 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRCA1P38398 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRCA1P38398 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRCA1P38398 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRCA1P38398 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
BRCA1P38398 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRCA1P38398 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRCA1P38398 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRCA1P38398 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRCA1P38398 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29■■■□□ 2.23
BRCA1P38398 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
BRCA1P38398 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
BRCA1P38398 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRCA1P38398 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRCA1P38398 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRCA1P38398 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
BRCA1P38398 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRCA1P38398 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRCA1P38398 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRCA1P38398 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRCA1P38398 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
BRCA1P38398 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRCA1P38398 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRCA1P38398 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRCA1P38398 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRCA1P38398 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRCA1P38398 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRCA1P38398 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BRCA1P38398 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BRCA1P38398 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
BRCA1P38398 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BRCA1P38398 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BRCA1P38398 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
BRCA1P38398 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRCA1P38398 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRCA1P38398 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRCA1P38398 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRCA1P38398 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRCA1P38398 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRCA1P38398 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRCA1P38398 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRCA1P38398 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRCA1P38398 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRCA1P38398 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRCA1P38398 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRCA1P38398 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRCA1P38398 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRCA1P38398 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRCA1P38398 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
BRCA1P38398 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRCA1P38398 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRCA1P38398 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRCA1P38398 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRCA1P38398 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRCA1P38398 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRCA1P38398 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms