Protein–RNA interactions for Protein: P35523

CLCN1, Chloride channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN1P35523 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLCN1P35523 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLCN1P35523 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLCN1P35523 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLCN1P35523 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLCN1P35523 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLCN1P35523 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLCN1P35523 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLCN1P35523 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CLCN1P35523 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CLCN1P35523 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms