Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RDXP35241 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RDXP35241 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RDXP35241 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RDXP35241 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RDXP35241 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RDXP35241 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RDXP35241 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RDXP35241 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RDXP35241 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RDXP35241 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RDXP35241 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RDXP35241 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RDXP35241 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RDXP35241 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RDXP35241 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RDXP35241 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RDXP35241 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RDXP35241 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RDXP35241 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RDXP35241 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RDXP35241 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RDXP35241 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RDXP35241 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RDXP35241 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RDXP35241 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RDXP35241 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RDXP35241 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RDXP35241 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RDXP35241 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RDXP35241 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RDXP35241 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RDXP35241 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RDXP35241 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RDXP35241 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RDXP35241 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RDXP35241 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RDXP35241 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RDXP35241 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RDXP35241 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RDXP35241 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RDXP35241 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RDXP35241 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RDXP35241 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RDXP35241 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RDXP35241 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RDXP35241 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RDXP35241 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RDXP35241 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RDXP35241 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RDXP35241 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RDXP35241 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RDXP35241 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RDXP35241 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RDXP35241 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RDXP35241 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RDXP35241 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RDXP35241 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RDXP35241 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RDXP35241 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RDXP35241 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RDXP35241 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RDXP35241 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RDXP35241 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RDXP35241 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RDXP35241 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RDXP35241 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RDXP35241 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RDXP35241 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RDXP35241 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RDXP35241 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RDXP35241 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RDXP35241 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RDXP35241 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RDXP35241 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RDXP35241 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RDXP35241 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RDXP35241 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RDXP35241 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RDXP35241 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RDXP35241 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RDXP35241 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RDXP35241 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RDXP35241 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RDXP35241 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RDXP35241 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RDXP35241 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RDXP35241 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RDXP35241 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RDXP35241 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RDXP35241 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RDXP35241 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RDXP35241 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RDXP35241 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RDXP35241 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RDXP35241 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RDXP35241 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RDXP35241 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RDXP35241 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RDXP35241 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms