Protein–RNA interactions for Protein: P35080

PFN2, Profilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFN2P35080 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PFN2P35080 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PFN2P35080 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PFN2P35080 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFN2P35080 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFN2P35080 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFN2P35080 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFN2P35080 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFN2P35080 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFN2P35080 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFN2P35080 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFN2P35080 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFN2P35080 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFN2P35080 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFN2P35080 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFN2P35080 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFN2P35080 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFN2P35080 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFN2P35080 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PFN2P35080 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PFN2P35080 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PFN2P35080 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFN2P35080 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PFN2P35080 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PFN2P35080 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PFN2P35080 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFN2P35080 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PFN2P35080 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PFN2P35080 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PFN2P35080 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFN2P35080 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFN2P35080 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFN2P35080 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFN2P35080 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFN2P35080 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PFN2P35080 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFN2P35080 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFN2P35080 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFN2P35080 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFN2P35080 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFN2P35080 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFN2P35080 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFN2P35080 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFN2P35080 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFN2P35080 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFN2P35080 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFN2P35080 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFN2P35080 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFN2P35080 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFN2P35080 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PFN2P35080 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFN2P35080 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFN2P35080 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFN2P35080 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFN2P35080 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFN2P35080 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFN2P35080 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFN2P35080 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFN2P35080 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFN2P35080 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFN2P35080 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFN2P35080 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFN2P35080 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFN2P35080 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFN2P35080 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFN2P35080 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFN2P35080 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFN2P35080 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFN2P35080 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFN2P35080 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFN2P35080 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFN2P35080 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFN2P35080 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFN2P35080 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFN2P35080 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFN2P35080 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFN2P35080 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFN2P35080 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFN2P35080 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFN2P35080 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFN2P35080 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFN2P35080 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFN2P35080 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFN2P35080 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFN2P35080 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFN2P35080 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFN2P35080 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFN2P35080 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFN2P35080 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFN2P35080 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PFN2P35080 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFN2P35080 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PFN2P35080 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PFN2P35080 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PFN2P35080 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PFN2P35080 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PFN2P35080 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PFN2P35080 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PFN2P35080 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PFN2P35080 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms