Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDH5P33151 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CDH5P33151 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDH5P33151 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH5P33151 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH5P33151 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH5P33151 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH5P33151 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH5P33151 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH5P33151 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH5P33151 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH5P33151 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH5P33151 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH5P33151 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH5P33151 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH5P33151 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH5P33151 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH5P33151 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH5P33151 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH5P33151 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH5P33151 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH5P33151 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH5P33151 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH5P33151 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH5P33151 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH5P33151 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH5P33151 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH5P33151 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH5P33151 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH5P33151 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH5P33151 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH5P33151 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH5P33151 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH5P33151 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH5P33151 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH5P33151 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH5P33151 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH5P33151 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH5P33151 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH5P33151 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH5P33151 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH5P33151 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH5P33151 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH5P33151 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH5P33151 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH5P33151 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH5P33151 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH5P33151 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH5P33151 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH5P33151 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH5P33151 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH5P33151 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH5P33151 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH5P33151 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH5P33151 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH5P33151 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH5P33151 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH5P33151 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH5P33151 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH5P33151 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH5P33151 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH5P33151 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH5P33151 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDH5P33151 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH5P33151 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH5P33151 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH5P33151 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH5P33151 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH5P33151 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH5P33151 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH5P33151 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH5P33151 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH5P33151 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH5P33151 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH5P33151 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH5P33151 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH5P33151 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH5P33151 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH5P33151 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH5P33151 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH5P33151 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH5P33151 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH5P33151 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH5P33151 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH5P33151 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH5P33151 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH5P33151 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH5P33151 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH5P33151 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH5P33151 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH5P33151 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH5P33151 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH5P33151 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH5P33151 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH5P33151 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH5P33151 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH5P33151 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH5P33151 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH5P33151 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH5P33151 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms