Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CPS1P31327 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CPS1P31327 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CPS1P31327 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CPS1P31327 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CPS1P31327 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CPS1P31327 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
CPS1P31327 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CPS1P31327 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CPS1P31327 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
CPS1P31327 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CPS1P31327 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CPS1P31327 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CPS1P31327 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
CPS1P31327 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
CPS1P31327 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CPS1P31327 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CPS1P31327 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CPS1P31327 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CPS1P31327 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CPS1P31327 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CPS1P31327 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
CPS1P31327 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CPS1P31327 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CPS1P31327 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CPS1P31327 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
CPS1P31327 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
CPS1P31327 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CPS1P31327 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CPS1P31327 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CPS1P31327 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CPS1P31327 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
CPS1P31327 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CPS1P31327 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CPS1P31327 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CPS1P31327 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CPS1P31327 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CPS1P31327 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
CPS1P31327 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CPS1P31327 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CPS1P31327 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CPS1P31327 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CPS1P31327 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
CPS1P31327 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CPS1P31327 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CPS1P31327 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CPS1P31327 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CPS1P31327 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CPS1P31327 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CPS1P31327 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CPS1P31327 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CPS1P31327 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CPS1P31327 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CPS1P31327 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CPS1P31327 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CPS1P31327 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CPS1P31327 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CPS1P31327 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CPS1P31327 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CPS1P31327 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CPS1P31327 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
CPS1P31327 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
CPS1P31327 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CPS1P31327 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CPS1P31327 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CPS1P31327 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CPS1P31327 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CPS1P31327 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CPS1P31327 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CPS1P31327 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CPS1P31327 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CPS1P31327 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CPS1P31327 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CPS1P31327 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CPS1P31327 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CPS1P31327 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CPS1P31327 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CPS1P31327 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CPS1P31327 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CPS1P31327 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CPS1P31327 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CPS1P31327 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CPS1P31327 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
CPS1P31327 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CPS1P31327 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CPS1P31327 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CPS1P31327 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CPS1P31327 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CPS1P31327 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CPS1P31327 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CPS1P31327 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CPS1P31327 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CPS1P31327 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CPS1P31327 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CPS1P31327 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CPS1P31327 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CPS1P31327 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CPS1P31327 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CPS1P31327 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CPS1P31327 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms