Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HOXC8P31273 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HOXC8P31273 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXC8P31273 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXC8P31273 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXC8P31273 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXC8P31273 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXC8P31273 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXC8P31273 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXC8P31273 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXC8P31273 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXC8P31273 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXC8P31273 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC8P31273 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC8P31273 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC8P31273 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC8P31273 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC8P31273 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC8P31273 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC8P31273 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC8P31273 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC8P31273 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXC8P31273 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXC8P31273 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXC8P31273 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXC8P31273 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXC8P31273 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXC8P31273 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXC8P31273 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXC8P31273 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXC8P31273 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXC8P31273 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXC8P31273 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXC8P31273 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXC8P31273 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXC8P31273 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXC8P31273 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXC8P31273 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXC8P31273 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXC8P31273 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXC8P31273 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXC8P31273 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXC8P31273 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXC8P31273 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms