Protein–RNA interactions for Protein: P30626

SRI, Sorcin, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRIP30626 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRIP30626 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRIP30626 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRIP30626 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRIP30626 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRIP30626 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRIP30626 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRIP30626 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRIP30626 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRIP30626 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRIP30626 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRIP30626 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRIP30626 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRIP30626 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRIP30626 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRIP30626 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRIP30626 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRIP30626 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRIP30626 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRIP30626 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRIP30626 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRIP30626 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRIP30626 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRIP30626 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRIP30626 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRIP30626 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRIP30626 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRIP30626 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRIP30626 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRIP30626 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRIP30626 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRIP30626 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRIP30626 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SRIP30626 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRIP30626 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRIP30626 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRIP30626 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRIP30626 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRIP30626 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRIP30626 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRIP30626 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRIP30626 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRIP30626 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRIP30626 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRIP30626 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRIP30626 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRIP30626 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRIP30626 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRIP30626 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SRIP30626 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRIP30626 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRIP30626 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRIP30626 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRIP30626 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRIP30626 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SRIP30626 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRIP30626 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRIP30626 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRIP30626 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRIP30626 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRIP30626 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRIP30626 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRIP30626 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRIP30626 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRIP30626 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SRIP30626 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRIP30626 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRIP30626 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRIP30626 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRIP30626 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRIP30626 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRIP30626 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRIP30626 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRIP30626 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRIP30626 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRIP30626 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRIP30626 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRIP30626 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRIP30626 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRIP30626 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRIP30626 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRIP30626 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRIP30626 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRIP30626 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRIP30626 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRIP30626 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRIP30626 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRIP30626 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRIP30626 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRIP30626 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SRIP30626 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRIP30626 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRIP30626 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRIP30626 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRIP30626 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRIP30626 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRIP30626 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRIP30626 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRIP30626 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRIP30626 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms