Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSPOP30536 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSPOP30536 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSPOP30536 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TSPOP30536 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSPOP30536 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSPOP30536 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSPOP30536 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSPOP30536 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TSPOP30536 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSPOP30536 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSPOP30536 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSPOP30536 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSPOP30536 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSPOP30536 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSPOP30536 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSPOP30536 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSPOP30536 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TSPOP30536 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TSPOP30536 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TSPOP30536 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TSPOP30536 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TSPOP30536 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TSPOP30536 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TSPOP30536 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TSPOP30536 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TSPOP30536 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TSPOP30536 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TSPOP30536 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TSPOP30536 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TSPOP30536 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TSPOP30536 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TSPOP30536 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TSPOP30536 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TSPOP30536 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TSPOP30536 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TSPOP30536 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TSPOP30536 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TSPOP30536 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TSPOP30536 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TSPOP30536 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TSPOP30536 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TSPOP30536 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TSPOP30536 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TSPOP30536 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TSPOP30536 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TSPOP30536 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TSPOP30536 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TSPOP30536 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TSPOP30536 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TSPOP30536 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TSPOP30536 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TSPOP30536 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TSPOP30536 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TSPOP30536 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TSPOP30536 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TSPOP30536 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TSPOP30536 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TSPOP30536 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TSPOP30536 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TSPOP30536 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TSPOP30536 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TSPOP30536 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TSPOP30536 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TSPOP30536 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TSPOP30536 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSPOP30536 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSPOP30536 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSPOP30536 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSPOP30536 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSPOP30536 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSPOP30536 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSPOP30536 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TSPOP30536 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSPOP30536 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSPOP30536 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSPOP30536 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSPOP30536 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSPOP30536 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSPOP30536 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSPOP30536 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSPOP30536 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSPOP30536 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSPOP30536 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSPOP30536 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TSPOP30536 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TSPOP30536 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSPOP30536 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSPOP30536 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSPOP30536 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSPOP30536 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSPOP30536 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSPOP30536 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSPOP30536 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSPOP30536 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSPOP30536 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSPOP30536 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSPOP30536 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSPOP30536 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSPOP30536 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms