Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF8P28908 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms