Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTFP26441 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTFP26441 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTFP26441 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTFP26441 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTFP26441 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTFP26441 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTFP26441 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTFP26441 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTFP26441 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTFP26441 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTFP26441 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTFP26441 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTFP26441 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTFP26441 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTFP26441 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTFP26441 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTFP26441 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTFP26441 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTFP26441 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTFP26441 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTFP26441 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTFP26441 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTFP26441 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTFP26441 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTFP26441 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTFP26441 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTFP26441 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CNTFP26441 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTFP26441 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTFP26441 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTFP26441 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTFP26441 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTFP26441 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTFP26441 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTFP26441 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTFP26441 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTFP26441 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTFP26441 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTFP26441 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTFP26441 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTFP26441 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTFP26441 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTFP26441 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTFP26441 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTFP26441 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTFP26441 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTFP26441 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTFP26441 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTFP26441 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTFP26441 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTFP26441 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTFP26441 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTFP26441 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTFP26441 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTFP26441 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTFP26441 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTFP26441 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTFP26441 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTFP26441 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTFP26441 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTFP26441 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTFP26441 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTFP26441 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTFP26441 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTFP26441 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTFP26441 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTFP26441 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTFP26441 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTFP26441 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTFP26441 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTFP26441 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTFP26441 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTFP26441 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTFP26441 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTFP26441 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTFP26441 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTFP26441 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTFP26441 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTFP26441 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTFP26441 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTFP26441 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTFP26441 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTFP26441 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTFP26441 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTFP26441 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTFP26441 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTFP26441 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTFP26441 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTFP26441 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTFP26441 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTFP26441 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTFP26441 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTFP26441 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTFP26441 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTFP26441 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTFP26441 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTFP26441 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTFP26441 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTFP26441 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 297.2 ms