Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NR4A1P22736 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR4A1P22736 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms