Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAB5AP20339 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms