Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCNA2P20248 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms