Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL2P19875 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
CXCL2P19875 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL2P19875 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL2P19875 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL2P19875 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL2P19875 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL2P19875 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL2P19875 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL2P19875 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL2P19875 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL2P19875 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL2P19875 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL2P19875 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL2P19875 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL2P19875 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CXCL2P19875 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CXCL2P19875 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CXCL2P19875 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CXCL2P19875 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CXCL2P19875 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CXCL2P19875 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CXCL2P19875 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL2P19875 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL2P19875 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL2P19875 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL2P19875 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL2P19875 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL2P19875 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL2P19875 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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