Protein–RNA interactions for Protein: P17039

ZNF30, Zinc finger protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF30P17039 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF30P17039 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF30P17039 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF30P17039 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF30P17039 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF30P17039 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF30P17039 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF30P17039 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF30P17039 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF30P17039 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms