Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACADSP16219 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACADSP16219 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACADSP16219 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACADSP16219 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACADSP16219 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACADSP16219 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACADSP16219 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ACADSP16219 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACADSP16219 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACADSP16219 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACADSP16219 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACADSP16219 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACADSP16219 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACADSP16219 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACADSP16219 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACADSP16219 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACADSP16219 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACADSP16219 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACADSP16219 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACADSP16219 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACADSP16219 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACADSP16219 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACADSP16219 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACADSP16219 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACADSP16219 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACADSP16219 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACADSP16219 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACADSP16219 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACADSP16219 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACADSP16219 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACADSP16219 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACADSP16219 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACADSP16219 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACADSP16219 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACADSP16219 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACADSP16219 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACADSP16219 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACADSP16219 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACADSP16219 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACADSP16219 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACADSP16219 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACADSP16219 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACADSP16219 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACADSP16219 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACADSP16219 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACADSP16219 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACADSP16219 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACADSP16219 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACADSP16219 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACADSP16219 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACADSP16219 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACADSP16219 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACADSP16219 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACADSP16219 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACADSP16219 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACADSP16219 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACADSP16219 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACADSP16219 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ACADSP16219 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACADSP16219 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACADSP16219 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACADSP16219 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACADSP16219 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACADSP16219 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACADSP16219 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACADSP16219 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ACADSP16219 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACADSP16219 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACADSP16219 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACADSP16219 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACADSP16219 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACADSP16219 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACADSP16219 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACADSP16219 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ACADSP16219 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACADSP16219 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACADSP16219 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ACADSP16219 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ACADSP16219 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACADSP16219 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACADSP16219 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ACADSP16219 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACADSP16219 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACADSP16219 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACADSP16219 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACADSP16219 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACADSP16219 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACADSP16219 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACADSP16219 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACADSP16219 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACADSP16219 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACADSP16219 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACADSP16219 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACADSP16219 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACADSP16219 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACADSP16219 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACADSP16219 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACADSP16219 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACADSP16219 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms