Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRF1P14222 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRF1P14222 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRF1P14222 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRF1P14222 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRF1P14222 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRF1P14222 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRF1P14222 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRF1P14222 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRF1P14222 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PRF1P14222 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PRF1P14222 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRF1P14222 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRF1P14222 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRF1P14222 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRF1P14222 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRF1P14222 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRF1P14222 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRF1P14222 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRF1P14222 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRF1P14222 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRF1P14222 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRF1P14222 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRF1P14222 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRF1P14222 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRF1P14222 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRF1P14222 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRF1P14222 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRF1P14222 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRF1P14222 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRF1P14222 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRF1P14222 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRF1P14222 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRF1P14222 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRF1P14222 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRF1P14222 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRF1P14222 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRF1P14222 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PRF1P14222 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRF1P14222 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRF1P14222 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRF1P14222 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PRF1P14222 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRF1P14222 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRF1P14222 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRF1P14222 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRF1P14222 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRF1P14222 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRF1P14222 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRF1P14222 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRF1P14222 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PRF1P14222 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRF1P14222 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRF1P14222 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRF1P14222 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRF1P14222 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRF1P14222 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRF1P14222 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRF1P14222 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRF1P14222 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRF1P14222 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRF1P14222 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRF1P14222 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRF1P14222 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRF1P14222 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PRF1P14222 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRF1P14222 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PRF1P14222 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRF1P14222 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRF1P14222 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRF1P14222 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRF1P14222 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRF1P14222 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRF1P14222 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRF1P14222 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRF1P14222 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRF1P14222 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRF1P14222 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRF1P14222 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRF1P14222 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PRF1P14222 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRF1P14222 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PRF1P14222 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRF1P14222 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRF1P14222 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRF1P14222 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRF1P14222 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRF1P14222 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRF1P14222 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRF1P14222 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRF1P14222 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PRF1P14222 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PRF1P14222 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PRF1P14222 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PRF1P14222 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRF1P14222 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PRF1P14222 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRF1P14222 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRF1P14222 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRF1P14222 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms