Protein–RNA interactions for Protein: P13385

TDGF1, Teratocarcinoma-derived growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDGF1P13385 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDGF1P13385 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDGF1P13385 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDGF1P13385 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDGF1P13385 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDGF1P13385 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDGF1P13385 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDGF1P13385 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TDGF1P13385 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TDGF1P13385 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDGF1P13385 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms