Protein–RNA interactions for Protein: P12081

HARS, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARSP12081 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HARSP12081 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HARSP12081 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HARSP12081 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HARSP12081 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HARSP12081 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HARSP12081 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HARSP12081 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HARSP12081 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HARSP12081 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HARSP12081 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HARSP12081 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HARSP12081 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HARSP12081 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HARSP12081 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HARSP12081 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HARSP12081 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HARSP12081 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HARSP12081 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HARSP12081 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HARSP12081 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HARSP12081 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HARSP12081 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HARSP12081 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HARSP12081 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HARSP12081 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HARSP12081 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HARSP12081 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HARSP12081 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HARSP12081 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HARSP12081 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
HARSP12081 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HARSP12081 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HARSP12081 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HARSP12081 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HARSP12081 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HARSP12081 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HARSP12081 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HARSP12081 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HARSP12081 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HARSP12081 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HARSP12081 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HARSP12081 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HARSP12081 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HARSP12081 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HARSP12081 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HARSP12081 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HARSP12081 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HARSP12081 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HARSP12081 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HARSP12081 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HARSP12081 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HARSP12081 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HARSP12081 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HARSP12081 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HARSP12081 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HARSP12081 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HARSP12081 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HARSP12081 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HARSP12081 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HARSP12081 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HARSP12081 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HARSP12081 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HARSP12081 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HARSP12081 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HARSP12081 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HARSP12081 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HARSP12081 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HARSP12081 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HARSP12081 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HARSP12081 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HARSP12081 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HARSP12081 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HARSP12081 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HARSP12081 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HARSP12081 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HARSP12081 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HARSP12081 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HARSP12081 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HARSP12081 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HARSP12081 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HARSP12081 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HARSP12081 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HARSP12081 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HARSP12081 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HARSP12081 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HARSP12081 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HARSP12081 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HARSP12081 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HARSP12081 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HARSP12081 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HARSP12081 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HARSP12081 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HARSP12081 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HARSP12081 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HARSP12081 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HARSP12081 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HARSP12081 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HARSP12081 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HARSP12081 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms