Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VPREB1P12018 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VPREB1P12018 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms