Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ODC1P11926 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ODC1P11926 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ODC1P11926 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ODC1P11926 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ODC1P11926 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ODC1P11926 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ODC1P11926 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ODC1P11926 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ODC1P11926 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ODC1P11926 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ODC1P11926 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ODC1P11926 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ODC1P11926 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ODC1P11926 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ODC1P11926 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ODC1P11926 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ODC1P11926 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ODC1P11926 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ODC1P11926 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ODC1P11926 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ODC1P11926 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ODC1P11926 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ODC1P11926 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ODC1P11926 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ODC1P11926 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ODC1P11926 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ODC1P11926 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ODC1P11926 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ODC1P11926 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ODC1P11926 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ODC1P11926 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ODC1P11926 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ODC1P11926 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ODC1P11926 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ODC1P11926 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ODC1P11926 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ODC1P11926 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ODC1P11926 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ODC1P11926 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ODC1P11926 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ODC1P11926 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ODC1P11926 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ODC1P11926 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ODC1P11926 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ODC1P11926 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ODC1P11926 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ODC1P11926 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ODC1P11926 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ODC1P11926 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ODC1P11926 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ODC1P11926 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ODC1P11926 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ODC1P11926 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ODC1P11926 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ODC1P11926 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ODC1P11926 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ODC1P11926 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ODC1P11926 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ODC1P11926 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ODC1P11926 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ODC1P11926 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ODC1P11926 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ODC1P11926 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ODC1P11926 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ODC1P11926 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ODC1P11926 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ODC1P11926 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ODC1P11926 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ODC1P11926 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ODC1P11926 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ODC1P11926 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ODC1P11926 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ODC1P11926 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ODC1P11926 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ODC1P11926 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ODC1P11926 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ODC1P11926 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ODC1P11926 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ODC1P11926 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ODC1P11926 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ODC1P11926 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ODC1P11926 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ODC1P11926 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ODC1P11926 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ODC1P11926 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ODC1P11926 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ODC1P11926 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ODC1P11926 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ODC1P11926 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ODC1P11926 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ODC1P11926 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ODC1P11926 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ODC1P11926 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ODC1P11926 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ODC1P11926 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ODC1P11926 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ODC1P11926 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ODC1P11926 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ODC1P11926 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms