Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC192P0DO97 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms