Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
POLR2MP0CAP2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLR2MP0CAP2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
POLR2MP0CAP2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR2MP0CAP2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR2MP0CAP2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR2MP0CAP2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR2MP0CAP2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR2MP0CAP2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR2MP0CAP2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR2MP0CAP2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR2MP0CAP2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR2MP0CAP2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR2MP0CAP2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR2MP0CAP2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR2MP0CAP2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR2MP0CAP2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR2MP0CAP2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR2MP0CAP2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR2MP0CAP2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2MP0CAP2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2MP0CAP2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2MP0CAP2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2MP0CAP2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2MP0CAP2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2MP0CAP2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2MP0CAP2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2MP0CAP2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR2MP0CAP2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR2MP0CAP2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR2MP0CAP2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR2MP0CAP2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR2MP0CAP2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLR2MP0CAP2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLR2MP0CAP2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLR2MP0CAP2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR2MP0CAP2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR2MP0CAP2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR2MP0CAP2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms