Protein–RNA interactions for Protein: P09497

CLTB, Clathrin light chain B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTBP09497 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLTBP09497 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLTBP09497 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLTBP09497 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLTBP09497 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLTBP09497 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLTBP09497 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLTBP09497 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLTBP09497 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLTBP09497 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLTBP09497 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTBP09497 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTBP09497 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTBP09497 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTBP09497 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTBP09497 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTBP09497 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTBP09497 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTBP09497 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTBP09497 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTBP09497 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTBP09497 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTBP09497 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTBP09497 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTBP09497 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLTBP09497 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLTBP09497 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLTBP09497 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLTBP09497 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLTBP09497 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTBP09497 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTBP09497 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTBP09497 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTBP09497 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTBP09497 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTBP09497 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTBP09497 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTBP09497 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTBP09497 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTBP09497 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTBP09497 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTBP09497 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTBP09497 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTBP09497 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTBP09497 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTBP09497 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTBP09497 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTBP09497 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTBP09497 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTBP09497 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTBP09497 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTBP09497 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTBP09497 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTBP09497 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTBP09497 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CLTBP09497 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLTBP09497 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CLTBP09497 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTBP09497 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTBP09497 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTBP09497 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTBP09497 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTBP09497 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTBP09497 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTBP09497 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTBP09497 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTBP09497 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTBP09497 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTBP09497 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTBP09497 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTBP09497 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTBP09497 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTBP09497 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTBP09497 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTBP09497 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTBP09497 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTBP09497 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTBP09497 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTBP09497 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTBP09497 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTBP09497 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTBP09497 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTBP09497 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTBP09497 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTBP09497 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTBP09497 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTBP09497 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLTBP09497 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLTBP09497 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLTBP09497 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLTBP09497 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLTBP09497 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLTBP09497 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLTBP09497 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLTBP09497 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLTBP09497 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLTBP09497 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLTBP09497 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLTBP09497 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLTBP09497 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms