Protein–RNA interactions for Protein: P07437

TUBB, Tubulin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP07437 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBBP07437 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBBP07437 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBBP07437 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBBP07437 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBBP07437 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBBP07437 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBBP07437 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBBP07437 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBBP07437 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TUBBP07437 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TUBBP07437 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TUBBP07437 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBBP07437 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBBP07437 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBBP07437 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBBP07437 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBBP07437 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBBP07437 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBBP07437 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBBP07437 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBBP07437 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBBP07437 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBBP07437 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBBP07437 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBBP07437 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBBP07437 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBBP07437 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBBP07437 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBBP07437 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBBP07437 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBBP07437 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBBP07437 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBBP07437 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBBP07437 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBBP07437 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBBP07437 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBBP07437 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBBP07437 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBBP07437 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBBP07437 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBBP07437 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBBP07437 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBBP07437 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBBP07437 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBBP07437 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBBP07437 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBBP07437 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBBP07437 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBBP07437 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBBP07437 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBBP07437 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBBP07437 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBBP07437 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBBP07437 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBBP07437 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBBP07437 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBBP07437 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBBP07437 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBBP07437 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBBP07437 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBBP07437 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBBP07437 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBBP07437 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBBP07437 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBBP07437 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBBP07437 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBBP07437 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBBP07437 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBBP07437 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBBP07437 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBBP07437 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBBP07437 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBBP07437 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBBP07437 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBBP07437 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBBP07437 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBBP07437 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBBP07437 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBBP07437 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBBP07437 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBBP07437 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBBP07437 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBBP07437 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBBP07437 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBBP07437 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBBP07437 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBBP07437 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBBP07437 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBBP07437 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBBP07437 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBBP07437 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBBP07437 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBBP07437 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBBP07437 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBBP07437 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBBP07437 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBBP07437 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBBP07437 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBBP07437 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms