Protein–RNA interactions for Protein: P04629

NTRK1, High affinity nerve growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK1P04629 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NTRK1P04629 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK1P04629 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms