Protein–RNA interactions for Protein: P02748

C9, Complement component C9, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P02748 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9P02748 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9P02748 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9P02748 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C9P02748 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9P02748 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9P02748 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9P02748 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9P02748 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9P02748 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9P02748 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9P02748 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9P02748 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C9P02748 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9P02748 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C9P02748 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9P02748 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9P02748 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9P02748 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9P02748 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9P02748 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9P02748 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9P02748 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9P02748 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9P02748 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9P02748 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9P02748 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9P02748 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9P02748 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9P02748 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9P02748 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C9P02748 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9P02748 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9P02748 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9P02748 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9P02748 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C9P02748 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9P02748 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9P02748 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C9P02748 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9P02748 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9P02748 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9P02748 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9P02748 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9P02748 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9P02748 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9P02748 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9P02748 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9P02748 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9P02748 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9P02748 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9P02748 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9P02748 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9P02748 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9P02748 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9P02748 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
C9P02748 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9P02748 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9P02748 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9P02748 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9P02748 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9P02748 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9P02748 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9P02748 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9P02748 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9P02748 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9P02748 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9P02748 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9P02748 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9P02748 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9P02748 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9P02748 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9P02748 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C9P02748 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9P02748 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9P02748 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C9P02748 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9P02748 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9P02748 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9P02748 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9P02748 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9P02748 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9P02748 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9P02748 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9P02748 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C9P02748 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9P02748 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9P02748 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9P02748 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9P02748 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9P02748 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9P02748 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9P02748 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9P02748 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9P02748 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9P02748 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9P02748 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9P02748 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9P02748 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9P02748 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms