Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTLL1O95922 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTLL1O95922 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTLL1O95922 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTLL1O95922 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTLL1O95922 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TTLL1O95922 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTLL1O95922 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTLL1O95922 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTLL1O95922 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTLL1O95922 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTLL1O95922 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTLL1O95922 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTLL1O95922 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTLL1O95922 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTLL1O95922 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTLL1O95922 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TTLL1O95922 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TTLL1O95922 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTLL1O95922 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTLL1O95922 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTLL1O95922 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTLL1O95922 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTLL1O95922 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTLL1O95922 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTLL1O95922 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTLL1O95922 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTLL1O95922 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TTLL1O95922 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTLL1O95922 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTLL1O95922 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTLL1O95922 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TTLL1O95922 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTLL1O95922 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms