Protein–RNA interactions for Protein: O95833

CLIC3, Chloride intracellular channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC3O95833 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.8 ms