Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
DDX58O95786 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DDX58O95786 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DDX58O95786 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
DDX58O95786 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
DDX58O95786 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDX58O95786 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDX58O95786 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDX58O95786 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDX58O95786 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDX58O95786 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDX58O95786 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDX58O95786 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDX58O95786 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDX58O95786 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
DDX58O95786 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
DDX58O95786 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
DDX58O95786 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
DDX58O95786 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
DDX58O95786 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
DDX58O95786 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
DDX58O95786 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
DDX58O95786 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDX58O95786 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDX58O95786 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDX58O95786 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDX58O95786 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDX58O95786 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
DDX58O95786 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DDX58O95786 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DDX58O95786 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DDX58O95786 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DDX58O95786 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DDX58O95786 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
DDX58O95786 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DDX58O95786 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DDX58O95786 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DDX58O95786 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDX58O95786 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
DDX58O95786 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDX58O95786 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DDX58O95786 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DDX58O95786 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DDX58O95786 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DDX58O95786 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DDX58O95786 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DDX58O95786 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DDX58O95786 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DDX58O95786 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
DDX58O95786 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDX58O95786 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDX58O95786 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDX58O95786 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDX58O95786 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDX58O95786 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDX58O95786 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDX58O95786 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDX58O95786 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDX58O95786 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DDX58O95786 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DDX58O95786 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DDX58O95786 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DDX58O95786 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DDX58O95786 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDX58O95786 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
DDX58O95786 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDX58O95786 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDX58O95786 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDX58O95786 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DDX58O95786 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DDX58O95786 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DDX58O95786 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DDX58O95786 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DDX58O95786 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DDX58O95786 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DDX58O95786 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DDX58O95786 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DDX58O95786 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DDX58O95786 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
DDX58O95786 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DDX58O95786 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DDX58O95786 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DDX58O95786 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DDX58O95786 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DDX58O95786 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DDX58O95786 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
DDX58O95786 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
DDX58O95786 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
DDX58O95786 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
DDX58O95786 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DDX58O95786 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DDX58O95786 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DDX58O95786 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DDX58O95786 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDX58O95786 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDX58O95786 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDX58O95786 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
DDX58O95786 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DDX58O95786 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DDX58O95786 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms