Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATE1O95260 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATE1O95260 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATE1O95260 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATE1O95260 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATE1O95260 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATE1O95260 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATE1O95260 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATE1O95260 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATE1O95260 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATE1O95260 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATE1O95260 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATE1O95260 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATE1O95260 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATE1O95260 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATE1O95260 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATE1O95260 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATE1O95260 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATE1O95260 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATE1O95260 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATE1O95260 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATE1O95260 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATE1O95260 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATE1O95260 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATE1O95260 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATE1O95260 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATE1O95260 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATE1O95260 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATE1O95260 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATE1O95260 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATE1O95260 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATE1O95260 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATE1O95260 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATE1O95260 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATE1O95260 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATE1O95260 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATE1O95260 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATE1O95260 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATE1O95260 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATE1O95260 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATE1O95260 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATE1O95260 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATE1O95260 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATE1O95260 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATE1O95260 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATE1O95260 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATE1O95260 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATE1O95260 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATE1O95260 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATE1O95260 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATE1O95260 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATE1O95260 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATE1O95260 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATE1O95260 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATE1O95260 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATE1O95260 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATE1O95260 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATE1O95260 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATE1O95260 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATE1O95260 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATE1O95260 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATE1O95260 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATE1O95260 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATE1O95260 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATE1O95260 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATE1O95260 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATE1O95260 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATE1O95260 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATE1O95260 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATE1O95260 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATE1O95260 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATE1O95260 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATE1O95260 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATE1O95260 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATE1O95260 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATE1O95260 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATE1O95260 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATE1O95260 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATE1O95260 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATE1O95260 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATE1O95260 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATE1O95260 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATE1O95260 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATE1O95260 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATE1O95260 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATE1O95260 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATE1O95260 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATE1O95260 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATE1O95260 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATE1O95260 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATE1O95260 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATE1O95260 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATE1O95260 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATE1O95260 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATE1O95260 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATE1O95260 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATE1O95260 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATE1O95260 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATE1O95260 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATE1O95260 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms