Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCTN3O75935 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms