Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG13O75143 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG13O75143 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG13O75143 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG13O75143 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG13O75143 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG13O75143 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG13O75143 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG13O75143 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG13O75143 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG13O75143 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG13O75143 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG13O75143 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG13O75143 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG13O75143 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG13O75143 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG13O75143 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG13O75143 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG13O75143 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG13O75143 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG13O75143 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG13O75143 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG13O75143 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG13O75143 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG13O75143 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG13O75143 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG13O75143 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG13O75143 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG13O75143 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG13O75143 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG13O75143 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG13O75143 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG13O75143 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG13O75143 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG13O75143 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG13O75143 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG13O75143 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATG13O75143 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG13O75143 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG13O75143 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG13O75143 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG13O75143 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG13O75143 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG13O75143 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG13O75143 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG13O75143 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG13O75143 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG13O75143 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG13O75143 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG13O75143 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG13O75143 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG13O75143 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG13O75143 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG13O75143 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG13O75143 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG13O75143 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG13O75143 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG13O75143 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG13O75143 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG13O75143 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG13O75143 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG13O75143 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG13O75143 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG13O75143 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG13O75143 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG13O75143 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG13O75143 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG13O75143 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG13O75143 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG13O75143 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG13O75143 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG13O75143 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG13O75143 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG13O75143 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG13O75143 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG13O75143 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG13O75143 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG13O75143 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG13O75143 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG13O75143 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG13O75143 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG13O75143 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG13O75143 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG13O75143 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG13O75143 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG13O75143 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG13O75143 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG13O75143 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG13O75143 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG13O75143 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG13O75143 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG13O75143 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG13O75143 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG13O75143 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG13O75143 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG13O75143 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG13O75143 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG13O75143 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG13O75143 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG13O75143 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms