Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC22O60826 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC22O60826 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC22O60826 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC22O60826 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC22O60826 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC22O60826 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms