Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL41O60662 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms