Protein–RNA interactions for Protein: O60637

TSPAN3, Tetraspanin-3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3O60637 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN3O60637 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN3O60637 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN3O60637 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN3O60637 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN3O60637 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN3O60637 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN3O60637 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN3O60637 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN3O60637 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN3O60637 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN3O60637 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN3O60637 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN3O60637 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN3O60637 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN3O60637 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN3O60637 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN3O60637 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN3O60637 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN3O60637 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN3O60637 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN3O60637 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN3O60637 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN3O60637 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN3O60637 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN3O60637 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN3O60637 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN3O60637 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN3O60637 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN3O60637 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN3O60637 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN3O60637 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN3O60637 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN3O60637 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN3O60637 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN3O60637 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN3O60637 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN3O60637 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN3O60637 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN3O60637 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN3O60637 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN3O60637 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN3O60637 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN3O60637 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN3O60637 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN3O60637 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN3O60637 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN3O60637 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN3O60637 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms